经过生死离别，车素薇决定原谅卢世君。卢世君还告诉了顾远一个秘密：顾远家人之死，和朝鲜特工有关。 一款手工香皂风靡租界，这种香皂不仅香气独特，还是由收留残障人士的公益香皂厂生产。而此时发生了几起命案，死者的皮都剥掉。而死者的身份都是流浪人士，为了获取这类人的线索，顾远康一臣决定卧底丐帮。 经过丐帮老蔡的指点，顾远等人捉住了剥皮凶手老耿。老耿供认自已剥皮是因为有人收购人皮。顾远决定找到买家，逮捕犯罪的源头。 此时又有一起剥皮案发生，死者竟然是养尊处优的商人吴三贝。而据吴三贝友人刘厂长所说，吴三贝死前欠了巨额高利贷。
高利贷商人范二爷被怀疑是杀害吴老板的凶手，但案发时他有不在场证明。而经过在吴府调查，顾远发现吴老板其实是吴太太家里的赘婿。 而吴老板因为入赘，一直被吴太太欺压，两人关系并不好。吴老板也因此和下人们勾勾搭搭，一个叫秀儿的下人就因此被吴太太逼得上吊自杀。而吴老板之所以欠高利贷，是因为他能力不足，经营的厂子快破产了。 经过调查，吴老板死前来过家中祠堂。顾远通过搜索盘问，锁定了犯罪嫌疑人，竟然是吴老板的傻儿子吴兴业——因为吴老板试图强奸儿媳。而对吴老板进行剥皮的，则是为了隐藏真相的儿媳谢婉莹。
通过检查，车素薇等人发现谢婉莹已有了身孕。但她怀孕时间，与嫁到吴家的时间明显对不上。那么谢婉莹怀得是谁的孩子？嫁到吴家前，又有什么样的身世呢？ 经过顾远等人调查，原来谢婉莹是歌女，和吴老板相好已经有一段时间。为了不让吴太太嫉恨，吴老板才让谢婉莹嫁给自已的傻儿子。那晚祠堂的“强奸”，其实是吴老板和谢婉莹在调情被发现。 顾远觉得谢婉莹认识吴老板，绝不是巧合。果然，刘老板也是谢婉莹的常客。刘老板曾经为了帮助吴老板还债，提出要收购吴老板的厂子。顾远等人从刘老板那要来收购合同，上面吴老板的名字是伪造的。 而此时的谢婉莹，偷走了吴家的另一份合同但被抓获。而派她偷合同的正是刘老板。
谢婉莹偷的合同里，写得竟然是刘老板无偿将自已的厂子转让给吴老板。这与之前的合同大相径庭。 康一臣调查刘老板厂子，发现了谢婉莹曾经是香皂厂的人。经过审问，原来谢婉莹被刘老板救过，为了报恩甘心当作刘老板的棋子偷合同。 顾远觉得刘老板不仅仅是经济案这么简单，不然为何吴老板能够让他甘心转厂子？肯定是他有把柄被吴老板握住。经过线索的拼接，顾远终于揭开真相：刘老板的香皂，都是用工厂里残障工人人皮所作，他的秘密被吴老板发现以至于被要挟。变态的刘老板才是剥皮案的罪魁祸首。 解决剥皮案后，租界精神病院又突然出现病人自杀事件，顾远等人前往侦破。院内的特殊疗法引起了车素薇注意。